OCR sistemi podržavaju otpremanje datoteka u više formata tako da korisnici mogu fleksibilno da konvertuju dokumente iz različitih izvora u tekst koji se može uređivati. U nastavku su neki uobičajeni formati datoteka koje OCR sistemi mogu podržavati:
Format slike:
JPEG/JPG: Široko korišćeni format kompresije slike pogodan za fotografije i skenirane dokumente.
PNG: Format komprimirane slike bez gubitaka koji podržava transparentnost i obično se koristi za web slike i ikone.
TIFF/TIF (uključujući višestrani TIFF): visokokvalitetni format slike koji se obično koristi u štamparskoj i izdavačkoj industriji i podržava dokumente sa više stranica.
BMP: Standardni format slike u Windows sistemima koji nije kompresovan, ima visok kvalitet, ali velike veličine datoteka.
GIF: Format slike koji podržava animaciju i transparentnost. Iako se uglavnom koristi za web slike, OCR sistemi ga takođe mogu podržavati.
Format dokumenta:
PDF: prenosivi format dokumenta koji se široko koristi za dijeljenje i štampanje dokumenata kao što su e-knjige, izvještaji i ugovori. OCR sistemi su obično u stanju da prepoznaju skenirani tekst u PDF datotekama.
Iako su OCR sistemi u stanju da obrađuju datoteke u više formata, datoteke u različitim formatima mogu imati različite efekte prepoznavanja tokom OCR procesa. Na primjer, TIFF datoteke sa visokim kvalitetom skeniranja i jasnim slikama obično su lakše za precizno prepoznavanje od JPEG datoteka. Stoga, kada biraju za otpremanje datoteka, korisnici bi trebali donijeti odluke na osnovu svojih potreba i kvaliteta datoteke.